STRuster

 STRuster results: 54421

 SCOP 1.71 classification
Class: Alpha and beta proteins (a+b)
Fold: Cystatin-like
Superfamily: Amine oxidase N-terminal region
Family: Amine oxidase N-terminal region
Protein: Copper amine oxidase, domains 1 and 2
Species: Arthrobacter globiformis
Species SCOP sunid: 54421

 Set description
Number of entries: 48
SCOP Entries: d1ivub2 d1ivub3 d1avl_2 d1avl_3 d1avk_3 d1avk_2 d1ivxa2 d1ivwb2 d1ivwb3 d1iqxa3 d1iqxa2 d1iqyb2 d1ivxb3 d1iqya3 d1siia2 d1ivwa3 d1ivwa2 d1iqxb2 d1iqyb3 d1ui8a3 d1ui8a2 d1ivxb2 d1iqya2 d1av4_2 d1av4_3 d1ui7a2 d1ui7a3 d1iqxb3 d1ui7b3 d1ui7b2 d1rjoa2 d1rjoa3 d1ivxa3 d1ivua3 d1ivua2 d1siia3 d1ivva2 d1ivva3 d1ui8b2 d1ui8b3 d1siha3 d1siha2 d1ivvb3 d1ivvb2 d1iu7a2 d1iu7a3 d1iu7b3 d1iu7b2
Alignment File: 54421.alig
Aligned Sequences: 54421_alig.fasta

 Hierarchical clustering
Dendrogram

Dissimilary matrix: 54421_dissim_matrix.txt

 Atom Distance Standard Deviation Plots
 S matrix: Distance Standard Deviation
distance standard deviation
Higher resolution plot
S matrix

 T matirx: Total Standard Deviation
distance+sus standard deviation
Higher resolution plot
T matrix

 R matrix: Relative Distance Standard Deviation
relative distance standard deviation
Higher resolution plot
R matrix

 Hinges and Invariant Regions (T)
 Hinges
Alignment Nr[(44, 45)]
Uniprot Nr [(53, 54)]

 Invariant Regions
Region1
Alignment Nr[(0, 43), (46, 202)]
Uniprot Nr[(9, 52), (55, 211)]
Superposition-